Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM88Q6PEY1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM88Q6PEY1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM88Q6PEY1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM88Q6PEY1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms