Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT80Q6KB66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT80Q6KB66 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT80Q6KB66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT80Q6KB66 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT80Q6KB66 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT80Q6KB66 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms