Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM71E1Q6IPT2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71E1Q6IPT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71E1Q6IPT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71E1Q6IPT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM71E1Q6IPT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71E1Q6IPT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71E1Q6IPT2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms