Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCAPH2Q6IBW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPH2Q6IBW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPH2Q6IBW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCAPH2Q6IBW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCAPH2Q6IBW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPH2Q6IBW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms