Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPECC1LQ69YQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPECC1LQ69YQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SPECC1LQ69YQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPECC1LQ69YQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPECC1LQ69YQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1LQ69YQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms