Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1Q5TB30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DEPDC1Q5TB30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEPDC1Q5TB30 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DEPDC1Q5TB30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms