Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA76

LCE3A, Late cornified envelope protein 3A, humanhuman

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Length 89 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3AQ5TA76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LCE3AQ5TA76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LCE3AQ5TA76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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