Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZK1Q5T2W1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZK1Q5T2W1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZK1Q5T2W1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1Q5T2W1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms