Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms