Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NUP188Q5SRE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP188Q5SRE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP188Q5SRE5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP188Q5SRE5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP188Q5SRE5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP188Q5SRE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms