Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP47Q5SQN1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP47Q5SQN1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP47Q5SQN1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP47Q5SQN1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms