Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPDYAQ5MJ70 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPDYAQ5MJ70 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYAQ5MJ70 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPDYAQ5MJ70 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPDYAQ5MJ70 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPDYAQ5MJ70 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPDYAQ5MJ70 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPDYAQ5MJ70 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms