Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD39Q53RE8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD39Q53RE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD39Q53RE8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD39Q53RE8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms