Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC92Q53HC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC92Q53HC0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC92Q53HC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms