Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL12Q53G59 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL12Q53G59 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL12Q53G59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL12Q53G59 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms