Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01620Q4KN68 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01620Q4KN68 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms