Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LONRF3Q496Y0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LONRF3Q496Y0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LONRF3Q496Y0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LONRF3Q496Y0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LONRF3Q496Y0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LONRF3Q496Y0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms