Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC153Q494R4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC153Q494R4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC153Q494R4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC153Q494R4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC153Q494R4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC153Q494R4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms