Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP20-2Q3LI61 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP20-2Q3LI61 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms