Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP21-3Q3LHN1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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