Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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