Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2ACQ16777 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIST2H2ACQ16777 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIST2H2ACQ16777 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIST2H2ACQ16777 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIST2H2ACQ16777 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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