Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMN1Q16637 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMN1Q16637 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMN1Q16637 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMN1Q16637 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
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