Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNXAQ16473 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNXAQ16473 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TNXAQ16473 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNXAQ16473 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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