Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USF2Q15853 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USF2Q15853 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USF2Q15853 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USF2Q15853 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USF2Q15853 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USF2Q15853 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USF2Q15853 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USF2Q15853 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USF2Q15853 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USF2Q15853 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USF2Q15853 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USF2Q15853 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USF2Q15853 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USF2Q15853 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USF2Q15853 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USF2Q15853 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USF2Q15853 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USF2Q15853 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USF2Q15853 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USF2Q15853 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USF2Q15853 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USF2Q15853 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USF2Q15853 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USF2Q15853 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USF2Q15853 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USF2Q15853 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USF2Q15853 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USF2Q15853 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USF2Q15853 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USF2Q15853 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USF2Q15853 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USF2Q15853 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USF2Q15853 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USF2Q15853 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USF2Q15853 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USF2Q15853 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USF2Q15853 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USF2Q15853 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USF2Q15853 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USF2Q15853 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USF2Q15853 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USF2Q15853 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USF2Q15853 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USF2Q15853 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USF2Q15853 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USF2Q15853 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USF2Q15853 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USF2Q15853 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USF2Q15853 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USF2Q15853 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USF2Q15853 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USF2Q15853 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USF2Q15853 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USF2Q15853 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USF2Q15853 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USF2Q15853 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USF2Q15853 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USF2Q15853 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USF2Q15853 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USF2Q15853 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USF2Q15853 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USF2Q15853 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USF2Q15853 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USF2Q15853 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USF2Q15853 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USF2Q15853 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USF2Q15853 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USF2Q15853 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USF2Q15853 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USF2Q15853 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USF2Q15853 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USF2Q15853 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USF2Q15853 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USF2Q15853 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USF2Q15853 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USF2Q15853 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USF2Q15853 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USF2Q15853 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USF2Q15853 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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