Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ALX1Q15699 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ALX1Q15699 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ALX1Q15699 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ALX1Q15699 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
ALX1Q15699 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ALX1Q15699 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
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