Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT3Q15649 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT3Q15649 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNHIT3Q15649 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT3Q15649 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT3Q15649 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT3Q15649 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT3Q15649 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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