Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ANKRD1Q15327 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ANKRD1Q15327 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ANKRD1Q15327 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD1Q15327 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ANKRD1Q15327 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ANKRD1Q15327 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ANKRD1Q15327 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ANKRD1Q15327 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ANKRD1Q15327 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms