Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPAQ15257 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPAQ15257 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPAQ15257 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPAQ15257 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPAQ15257 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPAQ15257 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPAQ15257 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPAQ15257 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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