Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 217.61■□□□□ 0.417e-6■■■■■ 27.3
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WDR43Q15061 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 217.48■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 416.94■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 27.3
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WDR43Q15061 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 27.3
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WDR43Q15061 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 515.4■□□□□ 0.067e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.017e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 27.3
WDR43Q15061 CARM1-208ENST00000590039 596 ntTSL 514.78□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.3
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WDR43Q15061 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 27.3
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WDR43Q15061 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 26.5
WDR43Q15061 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 26.5
WDR43Q15061 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.084e-6■■■■□ 26.5
WDR43Q15061 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 35.53□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 26.5
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WDR43Q15061 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.458e-7■■■■□ 26.4
WDR43Q15061 ITFG1-211ENST00000568047 2636 ntTSL 59.4□□□□□ -0.98e-7■■■■□ 26.4
WDR43Q15061 ITFG1-202ENST00000537184 1422 ntTSL 26.99□□□□□ -1.298e-7■■■■□ 26.4
WDR43Q15061 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 24.23□□□□□ -1.738e-7■■■■□ 26.4
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WDR43Q15061 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 26.3
WDR43Q15061 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 26.3
WDR43Q15061 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 26.3
WDR43Q15061 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.382e-21■■■■□ 26.2
WDR43Q15061 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.964e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 HECTD4-212ENST00000550724 587 ntTSL 319.1■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 26.1
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WDR43Q15061 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 26.1
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