Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD3Q15059 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD3Q15059 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD3Q15059 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD3Q15059 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD3Q15059 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD3Q15059 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD3Q15059 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD3Q15059 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD3Q15059 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD3Q15059 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD3Q15059 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD3Q15059 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
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BRD3Q15059 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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BRD3Q15059 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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BRD3Q15059 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
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BRD3Q15059 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
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