Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLINT1Q14677 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLINT1Q14677 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLINT1Q14677 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLINT1Q14677 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLINT1Q14677 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLINT1Q14677 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLINT1Q14677 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLINT1Q14677 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLINT1Q14677 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLINT1Q14677 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms