Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOFQ13790 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOFQ13790 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOFQ13790 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOFQ13790 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOFQ13790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOFQ13790 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOFQ13790 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOFQ13790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOFQ13790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOFQ13790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOFQ13790 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOFQ13790 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOFQ13790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOFQ13790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOFQ13790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOFQ13790 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOFQ13790 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOFQ13790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOFQ13790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOFQ13790 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOFQ13790 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOFQ13790 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOFQ13790 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOFQ13790 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOFQ13790 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOFQ13790 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOFQ13790 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOFQ13790 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOFQ13790 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOFQ13790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOFQ13790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOFQ13790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOFQ13790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOFQ13790 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOFQ13790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOFQ13790 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOFQ13790 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOFQ13790 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOFQ13790 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOFQ13790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOFQ13790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOFQ13790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOFQ13790 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOFQ13790 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOFQ13790 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOFQ13790 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOFQ13790 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOFQ13790 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOFQ13790 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOFQ13790 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOFQ13790 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOFQ13790 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOFQ13790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOFQ13790 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOFQ13790 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOFQ13790 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOFQ13790 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOFQ13790 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOFQ13790 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOFQ13790 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOFQ13790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOFQ13790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOFQ13790 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOFQ13790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOFQ13790 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOFQ13790 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOFQ13790 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOFQ13790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOFQ13790 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOFQ13790 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOFQ13790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOFQ13790 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOFQ13790 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOFQ13790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOFQ13790 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOFQ13790 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOFQ13790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOFQ13790 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOFQ13790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOFQ13790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOFQ13790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOFQ13790 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOFQ13790 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOFQ13790 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOFQ13790 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOFQ13790 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOFQ13790 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOFQ13790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOFQ13790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOFQ13790 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOFQ13790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOFQ13790 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOFQ13790 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOFQ13790 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOFQ13790 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOFQ13790 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOFQ13790 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOFQ13790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOFQ13790 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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