Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB3Q13751 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB3Q13751 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB3Q13751 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB3Q13751 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB3Q13751 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMB3Q13751 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB3Q13751 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMB3Q13751 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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