Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL2Q13617 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL2Q13617 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL2Q13617 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CUL2Q13617 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL2Q13617 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL2Q13617 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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