Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR3Q13615 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR3Q13615 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTMR3Q13615 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTMR3Q13615 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR3Q13615 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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