Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIPK1Q13546 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK1Q13546 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPK1Q13546 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK1Q13546 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK1Q13546 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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