Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms