Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTA1Q13424 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNTA1Q13424 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNTA1Q13424 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNTA1Q13424 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNTA1Q13424 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms