Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN31Q12999 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN31Q12999 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN31Q12999 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN31Q12999 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms