Protein–RNA interactions for Protein: Q12972

PPP1R8, Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R8Q12972 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R8Q12972 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R8Q12972 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R8Q12972 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP1R8Q12972 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R8Q12972 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R8Q12972 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R8Q12972 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R8Q12972 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R8Q12972 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms