Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BPTFQ12830 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPTFQ12830 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BPTFQ12830 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BPTFQ12830 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
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