Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAGPQ0VAQ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAGPQ0VAQ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms