Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITKQ08881 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITKQ08881 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITKQ08881 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITKQ08881 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITKQ08881 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITKQ08881 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITKQ08881 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITKQ08881 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITKQ08881 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITKQ08881 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITKQ08881 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITKQ08881 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITKQ08881 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITKQ08881 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITKQ08881 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITKQ08881 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITKQ08881 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITKQ08881 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITKQ08881 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITKQ08881 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITKQ08881 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITKQ08881 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITKQ08881 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITKQ08881 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITKQ08881 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITKQ08881 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITKQ08881 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITKQ08881 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITKQ08881 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITKQ08881 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITKQ08881 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITKQ08881 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITKQ08881 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITKQ08881 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITKQ08881 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITKQ08881 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITKQ08881 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITKQ08881 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITKQ08881 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITKQ08881 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITKQ08881 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITKQ08881 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITKQ08881 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITKQ08881 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITKQ08881 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITKQ08881 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITKQ08881 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITKQ08881 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ITKQ08881 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITKQ08881 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITKQ08881 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITKQ08881 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITKQ08881 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITKQ08881 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITKQ08881 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITKQ08881 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITKQ08881 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITKQ08881 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITKQ08881 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITKQ08881 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITKQ08881 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITKQ08881 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITKQ08881 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITKQ08881 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITKQ08881 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITKQ08881 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITKQ08881 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITKQ08881 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITKQ08881 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITKQ08881 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITKQ08881 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITKQ08881 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITKQ08881 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITKQ08881 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITKQ08881 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITKQ08881 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITKQ08881 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITKQ08881 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITKQ08881 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITKQ08881 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITKQ08881 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITKQ08881 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITKQ08881 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITKQ08881 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITKQ08881 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ITKQ08881 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms