Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN1Q05586 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN1Q05586 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN1Q05586 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN1Q05586 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN1Q05586 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN1Q05586 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms