Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD164Q04900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD164Q04900 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD164Q04900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD164Q04900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD164Q04900 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD164Q04900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD164Q04900 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD164Q04900 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD164Q04900 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD164Q04900 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD164Q04900 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD164Q04900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD164Q04900 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD164Q04900 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD164Q04900 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD164Q04900 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD164Q04900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD164Q04900 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD164Q04900 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD164Q04900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD164Q04900 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD164Q04900 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD164Q04900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD164Q04900 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD164Q04900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD164Q04900 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD164Q04900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD164Q04900 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD164Q04900 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD164Q04900 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD164Q04900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD164Q04900 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD164Q04900 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD164Q04900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD164Q04900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD164Q04900 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD164Q04900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD164Q04900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD164Q04900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD164Q04900 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD164Q04900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD164Q04900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD164Q04900 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD164Q04900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD164Q04900 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD164Q04900 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD164Q04900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD164Q04900 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD164Q04900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD164Q04900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD164Q04900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD164Q04900 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD164Q04900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD164Q04900 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD164Q04900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD164Q04900 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD164Q04900 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD164Q04900 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD164Q04900 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD164Q04900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD164Q04900 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD164Q04900 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD164Q04900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD164Q04900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD164Q04900 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD164Q04900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD164Q04900 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD164Q04900 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD164Q04900 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD164Q04900 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD164Q04900 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD164Q04900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CD164Q04900 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD164Q04900 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD164Q04900 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD164Q04900 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD164Q04900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD164Q04900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD164Q04900 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms