Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL10A1Q03692 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL10A1Q03692 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL10A1Q03692 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL10A1Q03692 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms