Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX6A2Q02221 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A2Q02221 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A2Q02221 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A2Q02221 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX6A2Q02221 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms