Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF2Q01130 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF2Q01130 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF2Q01130 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF2Q01130 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF2Q01130 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF2Q01130 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF2Q01130 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF2Q01130 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF2Q01130 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF2Q01130 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF2Q01130 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF2Q01130 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF2Q01130 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF2Q01130 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF2Q01130 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF2Q01130 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF2Q01130 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF2Q01130 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF2Q01130 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF2Q01130 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF2Q01130 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF2Q01130 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF2Q01130 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF2Q01130 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms