Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC5Q00444 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC5Q00444 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXC5Q00444 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC5Q00444 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms